目前精索静脉曲张手术治疗的方法主要有以下几种：传统开放手术（划刀子），腹腔镜手术（打孔），显微手术。手术的目的都是结扎曲张不健康的血管，消除反流，改善睾丸血液循环，促进睾丸生精功能。
显微手术是在医学手术显微镜下完成，不是简单的戴个手术放大镜。手术通常放大10倍，配合专用的血管判断设备，清晰完整的保留睾丸动脉（直径1毫米左右）、淋巴管，彻底结扎睾丸周围的不健康血管（精索内外等）。
精索静脉曲张的显微外科手术治疗的并发症有：
1. 水肿：精索静脉结扎术后水肿是最常见的并发症，发生率为3～39％，平均为7％，目前广泛认为阴囊水肿的机制和淋巴管的损伤有关。与精索动静脉伴行的淋巴管在手术过程中被损伤，导致淋巴液外渗，局部水肿明显，而静脉已被结扎，回流受阻，严重者可发生睾丸鞘膜积液。
2．睾丸萎缩：睾丸萎缩的发生率约为0.2%。睾丸动脉损伤是难以避免的一个方面，主要原因为结扎了睾丸动脉，导致睾丸血供急剧减少，从而发生缺血萎缩。然而多数学者认为在精索内动脉、输精管动脉和提睾肌动脉三者之间存在丰富的吻合支，即使误扎了睾丸动脉，后两支足以提供睾丸足够的血供，不会有严重后果，从目前的文献上看只有偶发的睾丸萎缩的并发症报道。显微镜精索静脉高位结扎术在放在10倍的视野下操作，能准确识别动脉、静脉和淋巴管，高选择结扎精索内静脉，保留睾丸动脉和淋巴管，可以避免阴囊水肿和睾丸鞘膜积液，同时也可以避免因动脉损伤引起的睾丸萎缩。美国泌尿外科协会明确推荐在精索静脉结扎术时采用放大技术以便更好地保护睾丸动脉。
3．精索静脉曲张持续存在或复发：精索静脉曲张术后持续存在或者复发的原因被认为在于漏扎精索内静脉的分支、精索外静脉以及引带静脉等。精索静脉结扎术后复发率为0.6～45％。不同作者、不同手术方式的报道各不相同。现有研究显示外环下途径显微精索静脉结扎术复发率较低。
4.急性附睾炎：术后出现急性附睾炎与术中结扎或损伤睾丸动脉有关， 因睾丸动脉与精索内静脉伴行， 术中易损伤。损伤后， 使本已处于缺氧、代谢障碍的附睾及睾丸在代偿血管未建立前缺氧进一步加重， 抵抗力进一步降低， 从而易于发生感染。此病患者主要表现为术后5～10天出现患侧阴囊肿胀、触痛、附睾肿大，边界不清，并伴发热。显微镜精索静脉高位结扎术在放在10倍的视野下操作，能准确识别动脉、静脉和淋巴管，高选择结扎精索内静脉，保留睾丸动脉，术后不影响睾丸动脉血供，可避免出现急性附睾炎。
5.输精管损伤：输精管损伤是精索静脉曲张手术理论上的并发症，因为在手术中，输精管呈白色，触之质地坚韧，管状结构，明显区别于周围的血管等组织的颜色和结构，任何泌尿及男科的医师都能正确辨认，并且加以分离，避免无意钳夹。
此外，还有其他少见的并发症，如术后腰背部、睾丸疼痛，可能与精索本身的解剖结构相关，在手术中过分牵拉精索可以引起肾区不适；偶尔也有神经损伤；切口感染，与无菌操作不严有关。因此，临床医师应注意预防和适当处理，并且术前应向患者及家属告知手术风险及可能发生的并发症。
